La déduction des charges permet de déduire tous les frais engagés au cours de l'exercice en cours. De son côté, l'amortissement permet de prendre en compte la perte de valeur du bien immobilier, des meubles ou des travaux. Grâce à ce mécanisme, les propriétaires LMNP peuvent déduire chaque année la perte de valeur du logement.